Title
Studija asocijacije genetičkih varijanti u regionima 7q36, 8q24 i 17q12 sa rizikom za razvoj i progresiju karcinoma prostate
Creator
Branković, Ana S., 1979-
Copyright date
2013
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno 3.0 Srbija (CC BY-NC 3.0)
License description
Dozvoljavate umnožavanje, distribuciju i javno saopštavanje dela, i prerade, ako se navede ime autora na način odredjen od strane autora ili davaoca licence. Ova licenca ne dozvoljava komercijalnu upotrebu dela. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/deed.sr_LATN Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 22.01.2014.
Other responsibilities
mentor
Brajušković, Goran, 1968-
član komisije
Savić-Pavićević, Dušanka, 1972-
član komisije
Vukotić, Vinka, 1955-
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
Academic Title
-
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Association study of common genetic variants in regions 7q36, 8q24 and 17q12 with prostate cancer
Publisher
Beograd : [A. S. Branković]
Format
PDF/A (151 list)
description
Biologija - Biohemija i molekularna biologija / Biology - Bichemistry and Molecular Biology
Abstract (sr)
Karcinom prostate je drugi najčešće dijagnostikovan maligni tumor muškaraca u svetu, i
šesti po broju smrtnih slučajeva. Standardni dijagnostički i prognostički parametri KP
su serumska vrednost prostata specifičnog antigena (PSA), Glison gradus sistem (GGS),
i klinički stadijum KP. Studije asocijacije na čitavom genomu identifikovale su preko
30 SNP asociranih sa rizikom za razvoj i progresiju KP. Genetičke varijante
predstavljaju potencijalne genetičke markere koji bi se pored standardnih prognostičkih
parametara koristili u dijagnostici i praćenju bolesnika sa KP. Rezultati replikativnih
studija slučajeva i kontrola potvrdili su da pojedinačne genetičke varijante mogu imati
različit stepen asocijacije sa rizikom za razvoj i/ili progresiju KP u različitim
populacijama.
Ova studija imala je za cilj da proceni moguću asocijaciju genotipova i alela
genetičkih varijanti u regionu 7q36 (rs1799983, rs2070744, NOS3 -764A>G, NOS3 -
714G>T, rs3918226, NOS3 -649G>A), regionu 8q24 (rs1447295, rs4242382,
rs6983267, rs7017300, rs7837688) i regionu 17q12 (rs3760511, rs7501939) sa rizikom
za razvoj i progresiju KP.
Studija je obuhvatala 150 bolesnika sa KP, 150 bolesnika sa benignom
hiperplazijom prostate (BPH) i 100 muškaraca bez kliničkih znakova bolesti prostate
(kontrolna grupa). Genotipizacija genetičkih varijanti vršena je metodom RFLP i
metodom automatskog sekvenciranja.
Za svih pet SNP u regionu 8q24 (rs1447295, rs4242382, rs6983267, rs7017300 i
rs7837688), kao i za rs7501939 iz regiona 17q12 pokazana je asocijacija sa rizikom za
razvoj KP. U našoj studiji, od 13 analiziranih genetičkih varijanti, za samo dve,
rs3760511 (region 17q12) i rs1799983 (region 7q36), pokazana je asocijacija sa
standarnim prognostičkim parametrima KP. Rezultati naše studije pokazali su asocijaciju genetičkih varijanti rs3760511 (region 17q12) i rs3198266 (region 7q36) sa
rizikom za progresiju KP...
Abstract (en)
Prostate cancer (PCa) is the second most frequently diagnosed malignant tumor, and the
sixth leading cause of cancer-related deaths among men worldwide. Standard diagnostic
and prognostic parameters are serum PSA level, Gleason gradus score, and the clinical
stage of PCa. Genome-wide association studies (GWAS) have identified over 30 single
nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with human PCa. Genetic variants have
emerged as potential genetic markers that could be used along with standard prognostic
parameters in PCa diagnostics and outcome prediction.
This study aimed to evaluate possible association between genotypes and alleles
of genetic variants at 7q36 (rs1799983, rs2070744, NOS3 -764A>G, NOS3 -714G>T,
rs3918226, and NOS3 -649G>A), 8q24 (rs1447295, rs4242382, rs6983267, rs7017300,
rs7837688) and 17q12 (rs3760511, rs7501939) with PCa risk and progression.
150 patients with PCa, 150 patients with benign prostatic hyperplasia (BPH),
and 100 men without clinical signs of prostate diseases (control group) were recruited as
study participants. The genotyping was performed by using PCR-RFLP analysis and bidirectional
DNA sequencing.
Our study has shown association for all five analized variants in the region 8q24
(rs1447295, rs4242382, rs6983267, rs7017300 and rs7837688) and rs7501939 in the
17q12 region with the risk of PCa. Among 13 variants analyzed in our study, two
(rs3760511 at 17q12 and rs1799983 at 7q36) have shown evidence of association with
standard prognostic parameters of PCa. Our study yielded evidence of association of
rs3760511 (17q12) and rs3198266 (7q36) with the risk of PCa progression.
The results of our study have shown the scientific racionale for conducting casecontrol
studies in Serbian population. The primal contribution of continuing reasearch regarding association between genetic variants and PCa risk and progression is in
defining the minimal panel of single nuclotide variants which would be used as nonstandard
prognostic parameters in PCa diagnostics and outcome prediction.
Authors Key words
studija asocijacije, genetičke varijante, karcinom prostate
Authors Key words
association study, genetic variants, prostate cancer
Classification
577.21 : [616-006.6 : 611.637] (043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Karcinom prostate je drugi najčešće dijagnostikovan maligni tumor muškaraca u svetu, i
šesti po broju smrtnih slučajeva. Standardni dijagnostički i prognostički parametri KP
su serumska vrednost prostata specifičnog antigena (PSA), Glison gradus sistem (GGS),
i klinički stadijum KP. Studije asocijacije na čitavom genomu identifikovale su preko
30 SNP asociranih sa rizikom za razvoj i progresiju KP. Genetičke varijante
predstavljaju potencijalne genetičke markere koji bi se pored standardnih prognostičkih
parametara koristili u dijagnostici i praćenju bolesnika sa KP. Rezultati replikativnih
studija slučajeva i kontrola potvrdili su da pojedinačne genetičke varijante mogu imati
različit stepen asocijacije sa rizikom za razvoj i/ili progresiju KP u različitim
populacijama.
Ova studija imala je za cilj da proceni moguću asocijaciju genotipova i alela
genetičkih varijanti u regionu 7q36 (rs1799983, rs2070744, NOS3 -764A>G, NOS3 -
714G>T, rs3918226, NOS3 -649G>A), regionu 8q24 (rs1447295, rs4242382,
rs6983267, rs7017300, rs7837688) i regionu 17q12 (rs3760511, rs7501939) sa rizikom
za razvoj i progresiju KP.
Studija je obuhvatala 150 bolesnika sa KP, 150 bolesnika sa benignom
hiperplazijom prostate (BPH) i 100 muškaraca bez kliničkih znakova bolesti prostate
(kontrolna grupa). Genotipizacija genetičkih varijanti vršena je metodom RFLP i
metodom automatskog sekvenciranja.
Za svih pet SNP u regionu 8q24 (rs1447295, rs4242382, rs6983267, rs7017300 i
rs7837688), kao i za rs7501939 iz regiona 17q12 pokazana je asocijacija sa rizikom za
razvoj KP. U našoj studiji, od 13 analiziranih genetičkih varijanti, za samo dve,
rs3760511 (region 17q12) i rs1799983 (region 7q36), pokazana je asocijacija sa
standarnim prognostičkim parametrima KP. Rezultati naše studije pokazali su asocijaciju genetičkih varijanti rs3760511 (region 17q12) i rs3198266 (region 7q36) sa
rizikom za progresiju KP...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.