Title
Fenotipska i genotipska karakterizacija i klonska povezanost faringealnih izolata streptokoka grupe A rezistentnih na makrolide u Srbiji
Creator
Gajić, Ina V., 1980-
Copyright date
2014
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno 3.0 Srbija (CC BY-NC 3.0)
License description
Dozvoljavate umnožavanje, distribuciju i javno saopštavanje dela, i prerade, ako se navede ime autora na način odredjen od strane autora ili davaoca licence. Ova licenca ne dozvoljava komercijalnu upotrebu dela. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/deed.sr_LATN Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
PhD thesis
description
Datum odbrane: 27.06.2014.
Other responsibilities
mentor
Vučković Opavski, Nataša, 1963-
član komisije
Ranin, Lazar, 1958-
član komisije
Mijač, Vera, 1972-
član komisije
Milenković, Marina, 1963-
Academic Expertise
Medicinske nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Medicinski fakultet
Alternative title
Phenotypic and genotypic Characterization and clonal Relatedness of pharyngeal Isolates of group a Streptococci resistant to Macrolides in Serbia
Publisher
Beograd : [I. V. Gajić]
Format
PDF/A (108 listova)
description
Molekularna medicina
- Mikrobiologija / Medicine - Microbiology
Abstract (sr)
Uvod: S. pyogenes je najčešći bakterijski uzročnik akutnih tonzilofaringitisa.
Iako su penicilinski preparati prva terapijska linija u lečenju streptokoknih faringitisa, u
slučajevima preosetljivosti na penicilin, propisuju se makrolidi. Početkom 21. veka,
uočen je porast rezistencije grupe A streptokoka (GAS) na eritromicin, širom sveta.
Dva glavna mehanizma rezistencije S. pyogenes na makrolide su aktivni efluks
antibiotika i izmena ciljnog mesta delovanja. Gen mefA, kodira proteine efluksne
pumpe, koji dovode do umerenog stepena rezistencije na 14-člane i 15-člane makrolide
(M fenotip). Drugi mehanizam rezistencije je metilacija ciljnog mesta delovanja
makrolida. On se odlikuje ukrštenom rezistencijom na makrolide, linkozamide i
streptogramine (MLS fenotip). Inducibilan MLS fenotip (iMLS) najčešće determiniše
ermA, a konstitutivan MLS fenotip (cMLS) ermB gen.
Najčešće korišćena metoda za tipizaciju GAS je emm tipizacija. Ova metoda se
zasniva na sekvenciranju hipervarijabilnog dela emm gena, koji kodira M protein, glavni
faktor virulencije GAS. MLST (engl. multilocus sequence typing) je metoda
genotipizacije, koja se bazira na umnožavanju i sekvenciranju 7 visoko konzerviranih,
tzv. „house-keeping” gena, koji kodiraju enzime od vitalnog značaja. RAPD (engl.
random amplified polymorphic DNA) metoda se bazira na nasumičnom umnožavanju
fragmenata DNK i elektroforetskom razdvajanju dobijenih produkata.
Cilj ove studije je bio da se proceni učestalost rezistencije grupe A streptokoka
na makrolide u Srbiji, da se odrede fenotipovi rezistencije na makrolide, da se odredi
distribucija gena koji kodiraju rezistenciju na makrolide i tetracikline, da se utvrdi
klonska distribucija i eventualna klonska veza među sojevima GAS rezistentnih na
makrolide (MRGAS), kao i da se proceni osetljivost MRGAS sojeva na druge klase
antibakterijskih lekova.
Materijal i metode: Analizirani su podaci o rezistenciji 3893 sojeva izolovanih
od pacijenata sa faringitisom, širom Srbije, u periodu od decembra 2007. do decembra
2008. godine. Sedamdeset sedam MRGAS izolata je poslato u Nacionalnu referentnu
laboratoriju za streptokok radi daljih ispitivanja. Identifikacija je vršena na osnovu
mikroskopskih, kulturelnih i biohemijskih osobina. Konzervacija je vršena u Todd Hewitt bujonu sa 10% sadržajem glicerola na -80°C...
Abstract (en)
Introduction: S. pyogenes is the most common causative agent of bacterial
tonsillopharyngitis. Penicillin is a first choice therapy for infections caused by GAS,
since penicillin resistance in streptococci has not yet emerged. Macrolides are preferred
for treatment of GAS infections in patients with beta-lactam hypersensitivity. At the
beginning of 2000s, significant increase in macrolide resistance has been reported from
many countries.
Two main well-described molecular mechanisms are responsible for macrolide
resistance among streptococci: target site modification and antibiotic efflux. Target site
modification due to methylase activity has been linked to the presence of erm gene. This
mechanism confers cross-resistance to macrolides, lincosamides and streptogramin
(MLS resistance). It can be constitutive (cMLS), usually mediated by the ermB gene or
inducible (iMLS), mediated by the ermA gene. The other mechanism of resistance,
macrolide efflux is encoded by mefA gene and confers low-level resistance to 14- and
15-membered macrolides.
The most common tool used to characterize isolates of S. pyogenes today is emm
typing, which is based on sequence at the 5’ end of emm gene that encode M protein,
one of the major virulence factor in GAS. Multilocus sequence typing (MLST) is
genotyping scheme based on nucleotide sequences of internal fragments of seven
selected housekeeping loci. Randomly amplification of polymorphic DNA (RAPD)
analysis is genotyping gel based method, with relatively high discriminatory index.
The aim of this study was to asses prevalence of macrolide resistance group A
streptococci (MRGAS) in Serbia, to determine genotypes and phenotypes of macrolide
resistance, as well as to evaluate resistance to tetracycline and to determine tetracycline
resistance genes. We were also investigated the clonal relatedness of macrolide
resistance strains and their susceptibility to other antimicrobial agents.
Material and methods: We evaluated resistance rate of MRGAS in Serbia by
analyzing data of 3893 pharyngeal isolates of GAS. A total of 77 MRGAS isolates,
originated from patients with pharyngitis, were collected from 7 regional laboratories
between December 2007 and 2008. Strains were sent to the National Reference Laboratory for streptococci for further testing...
Authors Key words
Streptococcus pyogenes, rezistencija, makrolidi, tetraciklini, geni, MLST,
RAPD, klon
Authors Key words
Streptococcus pyogenes, macrolide resistance, tetracycline
resistance, genes, emm typing, MLST, RAPD, clone
Classification
616.9
Type
Tekst
Abstract (sr)
Uvod: S. pyogenes je najčešći bakterijski uzročnik akutnih tonzilofaringitisa.
Iako su penicilinski preparati prva terapijska linija u lečenju streptokoknih faringitisa, u
slučajevima preosetljivosti na penicilin, propisuju se makrolidi. Početkom 21. veka,
uočen je porast rezistencije grupe A streptokoka (GAS) na eritromicin, širom sveta.
Dva glavna mehanizma rezistencije S. pyogenes na makrolide su aktivni efluks
antibiotika i izmena ciljnog mesta delovanja. Gen mefA, kodira proteine efluksne
pumpe, koji dovode do umerenog stepena rezistencije na 14-člane i 15-člane makrolide
(M fenotip). Drugi mehanizam rezistencije je metilacija ciljnog mesta delovanja
makrolida. On se odlikuje ukrštenom rezistencijom na makrolide, linkozamide i
streptogramine (MLS fenotip). Inducibilan MLS fenotip (iMLS) najčešće determiniše
ermA, a konstitutivan MLS fenotip (cMLS) ermB gen.
Najčešće korišćena metoda za tipizaciju GAS je emm tipizacija. Ova metoda se
zasniva na sekvenciranju hipervarijabilnog dela emm gena, koji kodira M protein, glavni
faktor virulencije GAS. MLST (engl. multilocus sequence typing) je metoda
genotipizacije, koja se bazira na umnožavanju i sekvenciranju 7 visoko konzerviranih,
tzv. „house-keeping” gena, koji kodiraju enzime od vitalnog značaja. RAPD (engl.
random amplified polymorphic DNA) metoda se bazira na nasumičnom umnožavanju
fragmenata DNK i elektroforetskom razdvajanju dobijenih produkata.
Cilj ove studije je bio da se proceni učestalost rezistencije grupe A streptokoka
na makrolide u Srbiji, da se odrede fenotipovi rezistencije na makrolide, da se odredi
distribucija gena koji kodiraju rezistenciju na makrolide i tetracikline, da se utvrdi
klonska distribucija i eventualna klonska veza među sojevima GAS rezistentnih na
makrolide (MRGAS), kao i da se proceni osetljivost MRGAS sojeva na druge klase
antibakterijskih lekova.
Materijal i metode: Analizirani su podaci o rezistenciji 3893 sojeva izolovanih
od pacijenata sa faringitisom, širom Srbije, u periodu od decembra 2007. do decembra
2008. godine. Sedamdeset sedam MRGAS izolata je poslato u Nacionalnu referentnu
laboratoriju za streptokok radi daljih ispitivanja. Identifikacija je vršena na osnovu
mikroskopskih, kulturelnih i biohemijskih osobina. Konzervacija je vršena u Todd Hewitt bujonu sa 10% sadržajem glicerola na -80°C...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.