Title
Квантно-хемијско и кристалографско испитивање С-Н/О интеракција ароматичних молекула
Creator
Veljković, Dušan Z.
Copyright date
2014
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 21.08.2014.
Other responsibilities
mentor
Zarić, Snežana, 1962-
član komisije
Miličić, Miloš
član komisije
Maslak, Veselin, 1970-
član komisije
Perić, Miljenko, 1949-
član komisije
Brothers, Edward
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Hemijski fakultet
Alternative title
Quantum-chemical and crystallographic study of С-Н/О interactions of aromatic molecules
Publisher
[Д. Вељковић]
Format
135 листова
description
Неорганска хемија / Inorganic chemistry
Abstract (sr)
Нековалентне интеракције имају велики значај у различитим
хемијским и биохемијским системима. Оне утичу на структуре биолошких
макромолекула као што су ДНК и РНК, а познавање ових интеракција је
од кључног значаја и за дизајнирање лекова и нових материјала. У овом
раду проучаване су енергије и геометрије С-Н/О интеракција између
ароматичних С-Н донора и различитих кисеоничних акцептора. Урађена
је анализа геометријских података из кристалних структура преузетих из
Кембричке банке кристалографских података, као и квантно-хемијски
прорачуни на модел системима.
Анализом геометријских података из кристалних структура које
садрже С-Н/О контакате између С-Н група С6-Н ароматичних фрагмената
и пиридина и различитих типова кисеоничних акцептора показано је да
С-Н/О интеракције у овим ароматичним системима не теже увек ка
линеарном распореду. Геометрија С-Н/О интеракција у великој мери
зависи од супституената у орто- положају у односу на интерагујућу С-Н
групу. Квантно-хемијски прорачуни рађени на различитим модел
системима показали су да су бифурковане интеракције јаче од линеарних
у оваквим системима. У случају С-Н/О интеракција нуклеинских база
статистичка анализа геометријских података је такође показала да ове
интеракције не теже увек линеарном распореду. Квантно-хемијски
прорачуни су показали да су најјаче С-Н/О интеракције у овим системима
бифурковане интеракције C-H/N-H типа, док су интеракције С-Н/С-Н
типа слабије од линеарних. Да би се објасниле наведене енергије
интеракција, израчунати су електростатички потенцијали молекула и
приказани у виду мапа електростатичког потенцијала.
Abstract (en)
Noncovalent interactions are of great importance in different chemical
and biochemical systems. They influence the structure of biological
macromolecules like DNA and RNA and knowledge of these interactions is
crucial in drug and material design. In this work energies and geometries of
C-H/O interactions between aromatic C-H donors and different oxygen
acceptors were studied. Analysis of geometrical data from crystal structures
from Cambridge structural database and quantum chemical calculations were
performed.
Analysis of geometrical data from crystal structures which contain
С-Н/О contacts between С-Н groups from С6-Н aromatic molecules as well as
pyridine molecule and different types of oxygen acceptors showed that С-Н/О
interactions of these aromatic systems do not show clear preference for linear
arrangement. Geometry of С-Н/О interactions mostly depends on type of
supstituent in ortho- position to interacting C-H group. Quantum chemical
calculations performed on different model systems showed that bifurcated
C-H/O interactions are stronger than linear interactions in these systems. In
case of С-Н/О interactions of nucleic bases statistical analysis of
crystallographic data also showed that these interactions do not show
preference towards linear arrangement. Quantum chemical calculations
showed that the strongest С-Н/О interactions in these systems are bifurcated
C-H/N-H interactions, and that С-Н/С-Н interactions are weaker than linear
С-Н/О interactions. To explain these interaction energies electrostatic
potentials of these molecules were calculated and visualized in form of
electrostatic potential map.
Authors Key words
С-Н/О интеракције, квантно-хемијски прорачуни,
Кембричка банка кристалографских података, ароматични системи
Authors Key words
С-Н/О interactions, quantum chemical calculations, Cambridge
structural database, aromatic systems
Classification
546
Type
Tekst
Abstract (sr)
Нековалентне интеракције имају велики значај у различитим
хемијским и биохемијским системима. Оне утичу на структуре биолошких
макромолекула као што су ДНК и РНК, а познавање ових интеракција је
од кључног значаја и за дизајнирање лекова и нових материјала. У овом
раду проучаване су енергије и геометрије С-Н/О интеракција између
ароматичних С-Н донора и различитих кисеоничних акцептора. Урађена
је анализа геометријских података из кристалних структура преузетих из
Кембричке банке кристалографских података, као и квантно-хемијски
прорачуни на модел системима.
Анализом геометријских података из кристалних структура које
садрже С-Н/О контакате између С-Н група С6-Н ароматичних фрагмената
и пиридина и различитих типова кисеоничних акцептора показано је да
С-Н/О интеракције у овим ароматичним системима не теже увек ка
линеарном распореду. Геометрија С-Н/О интеракција у великој мери
зависи од супституената у орто- положају у односу на интерагујућу С-Н
групу. Квантно-хемијски прорачуни рађени на различитим модел
системима показали су да су бифурковане интеракције јаче од линеарних
у оваквим системима. У случају С-Н/О интеракција нуклеинских база
статистичка анализа геометријских података је такође показала да ове
интеракције не теже увек линеарном распореду. Квантно-хемијски
прорачуни су показали да су најјаче С-Н/О интеракције у овим системима
бифурковане интеракције C-H/N-H типа, док су интеракције С-Н/С-Н
типа слабије од линеарних. Да би се објасниле наведене енергије
интеракција, израчунати су електростатички потенцијали молекула и
приказани у виду мапа електростатичког потенцијала.
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.