Title
Ispitivanje genetičke varijabilnosti i korelacije haplotipova medonosne pčele Apis mellifera i pčelinjeg krpelja Varroa destructor
Creator
Gajić, Bojan S., 1983-
Copyright date
2016
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Committee report
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 11.03.2016.
Other responsibilities
mentor
Kulišić, Zoran, 1958-
mentor
Radulović, Željko
član komisije
Stevanović, Jevrosima, 1970-
član komisije
Radojičić, Sonja, 1963-
član komisije
Stanimirović, Zoran, 1962-
Academic Expertise
Medicinske nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Fakultet veterinarske medicine
Alternative title
Analysis of genetic variability and haplotype correlation between honey bee Apis mellifera and honey bee mite Varroa destructor
Publisher
[ B. S. Gajić]
Format
180 listova
description
Veterinarska medicina - Parazitologija / Veterinary Medicine - Parasitology
Abstract (sr)
U ovom radu ispitivana je genetička varijabilnost medonosne pčele Apis
mellifera i pčelinjeg krpelja Varroa destructor, uz praćenje korelacije u distribuciji
haplotipova domaćina i parazita. Za identifikaciju haplotipova pčela korišćeni su uzorci
iz 48 pčelinjih društava sa osam lokaliteta na teritoriji Srbije, dok je za tipizaciju varoa i
praćenje korelacije haplotipova domaćina i parazita analizirano 245 uzoraka varoe iz 29
košnica.
Sekvencioniranjem tRNAleu-cox2 regiona definisano je šest haplotipova A.
mellifera, pri čemu je haplotip C2aa opisan po prvi put. Zastupljenost identifikovanih
haplotipova pčela razlikovala se u ukupnom uzorku, pri čemu je najzastupljeniji bio
haplotip C2d, dok su najmanje prisutni bili haplotipovi C2aa i C2i. Distribucija
haplotipova A. mellifera razlikovala se u zavisnosti od lokaliteta, pri čemu je na tri
posmatrana lokaliteta utvrđen po jedan haplotip, na jednom lokalitetu dva i na četiri
lokaliteta utvrđeno je prisustvo tri haplotipa pčela.
Rezultati sekvencioniranja delova mitohondrijalnih gena V. destructor otkrili su
prisustvo tačkastih mutacija na pozicijama 1932 i 10133 mtDNK unutar cox1 i cytb
sekvenci. Na osnovu tih polimorfnih mesta, definisana su dva nova haplotipa varoe koji
su nazvani Srbija 1 (S1) i Pešter 1 (P1). Obe otkrivene mutacije po svojoj prirodi
spadaju u „tihe‟ mutacije koje ne dovode do promene proteinskog lanca. Na
hromatogramima pojedinih uzoraka otkriveni su dupli pikovi na haplotip definišućim
mestima unutar cox1 i cytb, čime je po prvi put utvrđena nukleotidna heteroplazmija
kod vrste V. destructor.
Nakon utvrđivanja polimorfnih mesta metodom sekvencioniranja, za
identifikaciju haplotipova varoe i otkrivanje jedinki sa heteroplazmijom korišćene su
ARMS i RFLP metode. Analizom cox1 sekvence ARMS metodom utvrđeno je 48,2%
jedinki K haplotipa, 31,8% jedinki S1 haplotipa i 20,0% jedinki sa heteroplazmijom...
Abstract (en)
In this study, genetic variability of honey bee Apis mellifera and honey bee mite
Varroa destructor populations was analyzed, monitoring haplotype-based distribution
pattern between the host and the parasite. For the identification of honey bee
haplotypes, samples from 48 honey bee colonies were used, while 245 Varroa mite
samples originating from 29 colonies were analyzed for haplotype identification and
monitoring correlation between A. mellifera and V. destructor haplotypes. Sequencing
of tRNAleu-cox2 region revealed six A. mellifera haplotypes, with C2aa haplotype
observed for the first time. Different frequency of identifed bee haplotypes was detected
in total sample, with C2d haplotype being the most frequent, and C2aa and C2i
haplotypes with the lowest frequency. Distribution of A. mellifera haplotypes was found
to be dependent on the locality, with three sites represented by only one haplotype, one
locality represented by two haplotypes and four localities represented by three honey
bee haplotypes.
Sequencing results of V. destructor mitochondrial fragments revealed the point
mutations at position 1932 and 10133 mtDNA within cox1 and cytb sequences,
respectively. Based on these polymorphic sites, two novel Varroa haplotypes were
defined and named as Serbia 1 (S1) and Peshter 1 (P1). Both detected mutations were
the silent ones and did not affect the protein sequence. At the sequence chromatograms
in some of the analyzed samples, double peaks were detected at haplotype-defining sites
within cox1 and cytb, observing the phenomenon of nucleotide heteroplasmy for the
first time in V. destructor.
After the polymorphic sites had been observed using the sequencing method,
ARMS and RFLP assays were performed for identification of Varroa haplotypes and
detection of heteroplasmic individuals. Results of the cox1 sequence analysis showed
that 48,2% of individuals belonged to the K haplotype, 31,8% belonged to the S1
haplotype and 20,0% Varroa samples was found to be heteroplasmic...
Authors Key words
Apis mellifera, Varroa destructor, ARMS, RFLP, haplotipovi, mtDNK
heteroplazmija, korelacija
Authors Key words
Apis mellifera, Varroa destructor, ARMS, RFLP, haplotypes, mtDNA
heteroplasmy, correlation
Classification
619:595.799:576.89
Type
Tekst
Abstract (sr)
U ovom radu ispitivana je genetička varijabilnost medonosne pčele Apis
mellifera i pčelinjeg krpelja Varroa destructor, uz praćenje korelacije u distribuciji
haplotipova domaćina i parazita. Za identifikaciju haplotipova pčela korišćeni su uzorci
iz 48 pčelinjih društava sa osam lokaliteta na teritoriji Srbije, dok je za tipizaciju varoa i
praćenje korelacije haplotipova domaćina i parazita analizirano 245 uzoraka varoe iz 29
košnica.
Sekvencioniranjem tRNAleu-cox2 regiona definisano je šest haplotipova A.
mellifera, pri čemu je haplotip C2aa opisan po prvi put. Zastupljenost identifikovanih
haplotipova pčela razlikovala se u ukupnom uzorku, pri čemu je najzastupljeniji bio
haplotip C2d, dok su najmanje prisutni bili haplotipovi C2aa i C2i. Distribucija
haplotipova A. mellifera razlikovala se u zavisnosti od lokaliteta, pri čemu je na tri
posmatrana lokaliteta utvrđen po jedan haplotip, na jednom lokalitetu dva i na četiri
lokaliteta utvrđeno je prisustvo tri haplotipa pčela.
Rezultati sekvencioniranja delova mitohondrijalnih gena V. destructor otkrili su
prisustvo tačkastih mutacija na pozicijama 1932 i 10133 mtDNK unutar cox1 i cytb
sekvenci. Na osnovu tih polimorfnih mesta, definisana su dva nova haplotipa varoe koji
su nazvani Srbija 1 (S1) i Pešter 1 (P1). Obe otkrivene mutacije po svojoj prirodi
spadaju u „tihe‟ mutacije koje ne dovode do promene proteinskog lanca. Na
hromatogramima pojedinih uzoraka otkriveni su dupli pikovi na haplotip definišućim
mestima unutar cox1 i cytb, čime je po prvi put utvrđena nukleotidna heteroplazmija
kod vrste V. destructor.
Nakon utvrđivanja polimorfnih mesta metodom sekvencioniranja, za
identifikaciju haplotipova varoe i otkrivanje jedinki sa heteroplazmijom korišćene su
ARMS i RFLP metode. Analizom cox1 sekvence ARMS metodom utvrđeno je 48,2%
jedinki K haplotipa, 31,8% jedinki S1 haplotipa i 20,0% jedinki sa heteroplazmijom...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.