Title
Karakterizacija AggLb agregacionog faktora soja Lactobacillus paracasei subsp. paracasei BGNJ1-64
Creator
Miljković, Marija S., 1988-
Copyright date
2016
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Committee report
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 02.11.2016.
Other responsibilities
mentor
Kojić, Milan
mentor
Jovčić, Branko
član komisije
Lozo, Jelena, 1974-
član komisije
Kojić, Milorad
član komisije
Kojić, Milan
član komisije
Jovčić, Branko
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
Academic Title
-
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Characterization of AggLb aggregation factor from strain Lactobacillus paracasei subsp. paracasei BGNJ1-64
Publisher
[M. S. Miljković]
Format
138, [33] lista
description
Biologija - Molekularna genetika i genetiĉko inţenjerstvo / Biology
- Molecular genetics and genetic engineering
Abstract (sr)
Odgovor bakterija na uticaj razliĉitih faktora sredine koja ih okruţuje, kao i njihova
meĊusobna komunikacija, zavisi od procesa koji se odvijaju na površini bakterijskih ćelija. S
obzirom na brojne mogućnosti primene bakterija roda Lactobacillus, kako u prehrambenoj
industriji, tako i u medicini (u prevenciji i/ili leĉenju bolesti), potrebno je što bolje
okarakterisati komponente koje ĉine površinski sloj ovih bakterija. Agregacija bakterija,
determinisana faktorima lociranim na površini ćelija moţe se smatrati poţeljnom osobinom
pri izboru probiotika, s obzirom da ima vaţnu ulogu u meĊubakterijskoj interakciji, u
interakciji sa epitelijalnim ćelijama gastrointenstinalnog trakta i doprinosi sposobnosti
bakterija da se adsorbuju na razliĉite površine, odnosno sposobnost agregacije omogućava
uspešnu kolonizaciju staništa.
Kolekcija laktobacila Laboratorije za molekularnu mikrobiologiju je pretraţena na
prisustvo sojeva koji poseduju sposobnost agregacije (Agg+), nakon ĉega je za dalji rad
odabrano jedanaest sojeva: BGSJ2-8, BGGR2-68, BGGR2-82, BGDP1-84, BGDP9-38,
BGNJ1-3, BGNJ1-61, BGNJ1-64, BGNJ1-70, BGZLS30-6 i BGAR75. Odabrani Agg+ sojevi
se na osnovu stepena agregacije i tipa formiranih agregata mogu podeliti u tri grupe: oni koji
brzo, srednje i sporo agregiraju ili koji formiraju krupne, srednje i sitne agregate, pri ĉemu
postoji direktna korelacija izmeĊu brzine agregacije i tipa agregata. Analizom sposobnosti
vezivanja odabranih Agg+ sojeva laktobacila za komponente ekstracelularnog matriksa
(ECM) zapaţen je širok dijapazon sposobnosti vezivanja za kolagen - od intenzivnog afiniteta
vezivanja do odsustva sposobnosti vezivanja za matriks. Pritom su pojedini sojevi, BGGR2-
68 i BGGR2-82, ispoljili sposobnost vezivanja za plastiku (formiranje biofilma).
Analizom plazmidnog sastava Agg+ sojeva konstatovano je prisustvo velikih
plazmida u svim sojevima, a ĉišćenjem plazmida iz sojeva BGNJ1-64 i BGSJ2-8 potvrĊena je
plazmidna lokacija gena odgovornih za ekspresiju agregacionog fenotipa. Nakon konstrukcije
i analize plazmidnih biblioteka sojeva BGNJ1-64 i BGSJ2-8, izolovan je konstrukt pALb35
(koji nosi SacI fragment veliĉine 11,4 kb poreklom iz plazmida pNJ1 soja BGNJ1-64) koji
dovodi do ponovne pojave autoagregacionog fenotipa transformisanog heterologog domaćina
BGKP1-20 (Agg-)...
Abstract (en)
Response of bacteria to different environmental factors as well as their
communication primarily depends on the processes that occur on their cell surface. Due to the
continuously increasing number of application possibilities of lactobacilli, both in the food
industry and in medicine (in the prevention and/or treatment of the disease), there is a need
for a more comprehensive characterization of the components that form the surface layer of
these bacteria. Aggregation ability of bacteria, determined by factors located on the cell
surface could be considered as a desirable trait in the selection of probiotics. Since it plays an
important role in the interaction between bacteria, in interaction with the epithelial cells of
the gastrointestinal tract plus contributing to the bacterial capability to adhere to different
surfaces, which is an important feature enabling them to successfully colonize diverse
habitats.
Lactobacilli collection of Laboratory for molecular microbiology was screened for the
presence of strains possessing the aggregation ability (Agg+) and for the further work eleven
strains have been selected: BGSJ2-8, BGGR2-68, BGGR2-82, BGDP1-84, BGDP9-38,
BGNJ1-3, BGNJ1-61, BGNJ1-64, BGNJ1-70, BGZLS30-6 and BGAR75 which, according
to the level of aggregation and the appearance of the aggregates formed, could be clasified
into three groups: the fast, the medium and the slow aggregating ones or into the groups of
those forming large, medium or small aggregates wherein a direct correlation between the
aggregation kinetics and the type of the formed aggregates was found. By analyzing the
binding ability of the selected Agg+ strains of lactobacilli to the components of extracellular
matrix (ECM) a wide range of binding capacity to collagen was observed, varying from the
intensive to the complete lack of the binding capacity to the matrix. Two strains (BGGR2-68
and BGGR2-82) showed the ability to bind even to plastics (form biofilms).
By analyzing the plasmid composition of Agg+ strains, the presence of large plasmids
was detected in all strains. The plasmid curing experiments confirmed the plasmid location of
the gene(s) responsible for the expression of aggregation phenotype in strains BGNJ1-64 and
BGSJ2-8. After the construction and analysis of BGNJ1-64 and BGSJ2-8 strains plasmid
libraries, selected construct pALb35 (which carries the SacI fragment of 11.4 kb. derived
from plasmid pNJ1 from strain BGNJ1-64) was able to reconstitute the autoagreggation
ability of the transformed heterologous host BGKP1-20 (Agg-)...
Authors Key words
Laktobacili, agregacija, agregacioni faktor AggLb, kolagen vezujući domeni,
kolagen vezujući domeni B (CnaB-like), varijante AggLb proteina, adhezija, ekskluzija
patogena, biofilm
Authors Key words
Lactobacilli, aggregation, aggregation factor AggLb, collagen binding domain,
collagen binding domain B (CnaB-like), variants of AggLb protein, adhesion, exclusion of
pathogens, biofilm
Classification
579.864:577.11(043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Odgovor bakterija na uticaj razliĉitih faktora sredine koja ih okruţuje, kao i njihova
meĊusobna komunikacija, zavisi od procesa koji se odvijaju na površini bakterijskih ćelija. S
obzirom na brojne mogućnosti primene bakterija roda Lactobacillus, kako u prehrambenoj
industriji, tako i u medicini (u prevenciji i/ili leĉenju bolesti), potrebno je što bolje
okarakterisati komponente koje ĉine površinski sloj ovih bakterija. Agregacija bakterija,
determinisana faktorima lociranim na površini ćelija moţe se smatrati poţeljnom osobinom
pri izboru probiotika, s obzirom da ima vaţnu ulogu u meĊubakterijskoj interakciji, u
interakciji sa epitelijalnim ćelijama gastrointenstinalnog trakta i doprinosi sposobnosti
bakterija da se adsorbuju na razliĉite površine, odnosno sposobnost agregacije omogućava
uspešnu kolonizaciju staništa.
Kolekcija laktobacila Laboratorije za molekularnu mikrobiologiju je pretraţena na
prisustvo sojeva koji poseduju sposobnost agregacije (Agg+), nakon ĉega je za dalji rad
odabrano jedanaest sojeva: BGSJ2-8, BGGR2-68, BGGR2-82, BGDP1-84, BGDP9-38,
BGNJ1-3, BGNJ1-61, BGNJ1-64, BGNJ1-70, BGZLS30-6 i BGAR75. Odabrani Agg+ sojevi
se na osnovu stepena agregacije i tipa formiranih agregata mogu podeliti u tri grupe: oni koji
brzo, srednje i sporo agregiraju ili koji formiraju krupne, srednje i sitne agregate, pri ĉemu
postoji direktna korelacija izmeĊu brzine agregacije i tipa agregata. Analizom sposobnosti
vezivanja odabranih Agg+ sojeva laktobacila za komponente ekstracelularnog matriksa
(ECM) zapaţen je širok dijapazon sposobnosti vezivanja za kolagen - od intenzivnog afiniteta
vezivanja do odsustva sposobnosti vezivanja za matriks. Pritom su pojedini sojevi, BGGR2-
68 i BGGR2-82, ispoljili sposobnost vezivanja za plastiku (formiranje biofilma).
Analizom plazmidnog sastava Agg+ sojeva konstatovano je prisustvo velikih
plazmida u svim sojevima, a ĉišćenjem plazmida iz sojeva BGNJ1-64 i BGSJ2-8 potvrĊena je
plazmidna lokacija gena odgovornih za ekspresiju agregacionog fenotipa. Nakon konstrukcije
i analize plazmidnih biblioteka sojeva BGNJ1-64 i BGSJ2-8, izolovan je konstrukt pALb35
(koji nosi SacI fragment veliĉine 11,4 kb poreklom iz plazmida pNJ1 soja BGNJ1-64) koji
dovodi do ponovne pojave autoagregacionog fenotipa transformisanog heterologog domaćina
BGKP1-20 (Agg-)...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.