Title
Molekularna karakterizacija sojeva virusa Parainfluence 3 goveda izolovanih na teritoriji Republike Srbije
Creator
Veljović, Ljubiša M., 1964-
Copyright date
2016
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Committee report
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 28.06.2016.
Other responsibilities
mentor
Milić, Nenad, 1960-
član komisije
Nišavić, Jakov, 1971-
član komisije
Krnjaić, Dejan, 1964-
član komisije
Knežević, Aleksandra, 1970-
Academic Expertise
Medicinske nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Fakultet veterinarske medicine
Alternative title
Molecular characterisation of Parainfluenza 3 virus strains of cattle isolated on the theritory of Republic of Serbia
Publisher
[Lj. M. Veljović]
Format
138 listova
description
veterinarska medicina - mikrobiologija / Veterinary medicine - Microbiology
Abstract (sr)
Glavni cilj ove doktorske disertacije je da se izvrši identifikacija i molekularna
karakterizacija izolovanih sojeva virusa parainfluence 3 (PI3) goveda sa teritorije
Republike Srbije. Izvršena ispitivanja su obuhvatila izolaciju virusa parainfluence 3 iz
nosnih briseva goveda na kulturi tkiva i identifikaciju izolovanih sojeva virusa metodom
virusneutralizacije, direktne imunofluorescencije i njihovu molekularnu karakterizaciju
metodom lanĉane reakcije polimeraze (RT PCR) uz korišćenje prajmera za
konzervisane regione HN i F gena virusa PI3 goveda sa sekvenciranjem radi njihove
genotipizacije i svrstavanja na filogenetsko stablo izolovanih sojeva pomenutog
patogena. Filogenetska analiza izolovanih sojeva izvršena je na osnovu utvrĊivanja
homologije i poreĊenja pozicije njihovih nukleotidnih sekvenci sa sekvencama
registrovanih sojeva virusa u bazi gena. Na osnovu nukleotidne homologije i pozicije
domaćih izolovanih sojeva virusa na filogenetskom stablu, izvršena je njihova
genotipizacija.
U navedenim ispitivanjima je korišćen referentni soj SF4 virusa PI3 goveda
(izolovan u drţavi Tenesi ,SAD). Nazalni brisevi poreklom od 119 goveda razliĉitih
rasnih i starosnih kategorija sa ispoljenim simptomima infekcije gornjih partija
respiratornog trakta su ispitivani na prisustvo virusa PI3 metodom izolacije na ćelijskoj
liniji MDBK (Madin Darby Bovine Kidney). Izolacija virusa vršena je posle najviše tri
pasaţe suspektnog materijala na navedenoj ćelijskoj liniji do pojave citopatogenog
efekta. Citopatogeni efekat je ustanovljen u ćelijskim linijama posle inokulacije 11
uzoraka ispitivanog materijala, dok je primenom metode virusneutralizacije i direktne
imunofluorescencije ustanovljeno prisustvo virusa parainfluece 3 kod 6 inokulisanih
ćelijskih linija. U ostalim ćelijskim linijama, pojedinaĉno inokulisanim sa po 5 uzoraka
poreklom od ispitivanih nosnih briseva goveda nije dokazano prisustvo virusa
parainfluence 3 primenom prethodno navedenih metoda...
Abstract (en)
The main objective of this doctoral thesis was the identification and molecular
characterization of isolated strains of parainfluenza 3 (PI3) from cattle on the territory
of the Republic of Serbia. The investigations included isolation of parainfluenza 3 virus
from nasal swabs from cattle in tissue culture and identification of isolated strains of the
virus by method of virusneutralisation, direct imunoflurescense and their molecular
caracterisation by method of polymerase chain reaction (RT-PCR) using primers from
conserved regions of the HN and F genes of the virus PI3 cattle, with sequencing and
genotyping of domestic strains by help of their inclusion on the phylogenetic tree of
mentioned pathogens. Phylogenetic analysis of the isolated strains was carried out on
the basis of determination of the homology of the nucleotide sequences with the
sequences of strains of the virus registered in gene base NCBI . Genotyping of domestic
strains was done on the basis of nucleotide homology and position of local isolated
virus strains on the phylogenetic tree, of PI3 virus.
In these experiments, reference strain SF4 of virus PI3 of cattle was used
(isolated in Tennessee, USA). Nasal swabs originating from 119 cattle with symptoms
of infection in upper parts of the respiratory tract were examined for the presence of the
virus PI3 by method of isolation of virus on cell line MDBK (Madin Darby Bovine
Kidney). Virus isolation was done after three passages of suspected material on cell line
till the appearance of cytopathic effect. Cytopathic effect was detected in cell lines after
inoculation of 11 tested samples, while applying the method of virusneutralisation and
direct immunofluorescense, identification of the virus parainfluece 3 were conformed in
6 inoculated cell lines, but not confirmed in other 5 tested samples from nasal swabs of
cattle...
Authors Key words
virus parainfluenza 3, goveda, izolacija virusa, imunofluorescencija,
RT PCR, sekvenciranje, molekularna karakterizacija, filogenetsko stablo
Authors Key words
bovine parainfluenza 3 virus, cattle, virus isolation, immunofluorescence,
RT-PCR, sequencing, molecular characterization, phylogenetic tree
Classification
579.62:578.2:636.2
Type
Tekst
Abstract (sr)
Glavni cilj ove doktorske disertacije je da se izvrši identifikacija i molekularna
karakterizacija izolovanih sojeva virusa parainfluence 3 (PI3) goveda sa teritorije
Republike Srbije. Izvršena ispitivanja su obuhvatila izolaciju virusa parainfluence 3 iz
nosnih briseva goveda na kulturi tkiva i identifikaciju izolovanih sojeva virusa metodom
virusneutralizacije, direktne imunofluorescencije i njihovu molekularnu karakterizaciju
metodom lanĉane reakcije polimeraze (RT PCR) uz korišćenje prajmera za
konzervisane regione HN i F gena virusa PI3 goveda sa sekvenciranjem radi njihove
genotipizacije i svrstavanja na filogenetsko stablo izolovanih sojeva pomenutog
patogena. Filogenetska analiza izolovanih sojeva izvršena je na osnovu utvrĊivanja
homologije i poreĊenja pozicije njihovih nukleotidnih sekvenci sa sekvencama
registrovanih sojeva virusa u bazi gena. Na osnovu nukleotidne homologije i pozicije
domaćih izolovanih sojeva virusa na filogenetskom stablu, izvršena je njihova
genotipizacija.
U navedenim ispitivanjima je korišćen referentni soj SF4 virusa PI3 goveda
(izolovan u drţavi Tenesi ,SAD). Nazalni brisevi poreklom od 119 goveda razliĉitih
rasnih i starosnih kategorija sa ispoljenim simptomima infekcije gornjih partija
respiratornog trakta su ispitivani na prisustvo virusa PI3 metodom izolacije na ćelijskoj
liniji MDBK (Madin Darby Bovine Kidney). Izolacija virusa vršena je posle najviše tri
pasaţe suspektnog materijala na navedenoj ćelijskoj liniji do pojave citopatogenog
efekta. Citopatogeni efekat je ustanovljen u ćelijskim linijama posle inokulacije 11
uzoraka ispitivanog materijala, dok je primenom metode virusneutralizacije i direktne
imunofluorescencije ustanovljeno prisustvo virusa parainfluece 3 kod 6 inokulisanih
ćelijskih linija. U ostalim ćelijskim linijama, pojedinaĉno inokulisanim sa po 5 uzoraka
poreklom od ispitivanih nosnih briseva goveda nije dokazano prisustvo virusa
parainfluence 3 primenom prethodno navedenih metoda...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.