Title
Strukturna i funkcionalna analiza 5' regulatornog regiona gena SMAD4 u karcinomu pankreasa čoveka
Creator
Nikolić, Aleksandra, 1975-
Copyright date
2010
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 16.04.2010.
Other responsibilities
mentor
Radojković, Dragica
član komisije
Radović, Svetlana, 1958-
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Structural and functional analysis of smad4 gene 5' regulatory region in human pancreatic cancer
Publisher
[A. Nikolić]
Format
PDF/A (114 listova)
description
Molekularna biologija / Molecular biology
Abstract (sr)
Karcinom pankreasa spada u najinvazivnije i najprogresivnije humane maligne bolesti. Genetske promene karakteristične za ovu bolest su aktivacija onkogena KRAS i inaktivacija tumor supresor gena p16, p53 i SMAD4. Novija istraživanja ukazuju na povezanost aktivacije onkogena KRAS i inaktivacije tumor supresor gena SMAD4 u pankreasnoj karcinogenezi. Struktura promotora gena SMAD4 nedovoljno je proučena i malo se zna o mehanizmima regulacije transkripcije ovog gena. Ova studija je imala za cilj da istraži genetske i epigenetske promene u 5’ regulatornom regionu gena SMAD4 kao potencijalne mehanizme njegove inaktivacije u karcinomu pankreasa, kao i njihovu udruženost sa prisustvom mutacije u kodonu 12 gena KRAS u malignom tkivu.
Strukturna analiza promotora gena SMAD4 je pokazala da su dva mononukleotidna ponovka, -462T(15) and -4T(12), polimorfna u karcinomu pankreasa i kolorektalnom kanceru, dok je funkcionalna analiza pokazala da broj timina u elementu -4T(12) može biti od značaja za regulaciju transkripcije. Haplotip 14/10 je bio najčešći haplotip u tkivu karcinoma pankreasa, prisutan u 88% slučajeva. Haplotipovi 10/12 i 9/12 su otkriveni u po 4% slučajeva u tkivu kolorektalnog kancera. U najvećem broju tkiva karcinoma pankreasa (98%) bila je prisutna ili mutacija u kodonu 12 gena KRAS ili haplotip 14/10 u promotoru gena SMAD4.
Rezultati ovog istraživanja ukazuju da haplotipovi 14/10, 10/12 i 9/12 u promotoru gena SMAD4 predstavljaju genetičke markere koji mogu biti povezani sa specifičnom malignom bolešću, a njihova analiza potencijalno iskorišćena za dijagnostikovanje i praćenje bolesti, pojedinačno ili u kombinaciji sa analizom mutacije u kodonu 12 gena KRAS.
Abstract (en)
Pancreatic carcinoma is one of the most invasive and progressive human malignant neoplasms. This malignancy is characterized by activation of KRAS oncogene and inactivation of p16, p53 and SMAD4 tumor supressor genes. Recent results show association between KRAS activation and SMAD4 inactivation in pancreatic carcinogenesis. The structure of the SMAD4 gene promoter has not been clearly defined and little is known about the transcription regulatory mechanisms of this gene. This study was aimed at analyzing genetic and epigenetic changes in the 5’ regulatory region as potential mechanisms of SMAD4 gene inactivation in pancreatic carcinoma and their coexistance with KRAS codon 12 mutation in malignant tissues.
Structural analysis of SMAD4 gene promoter has shown that two mononucleotide repeat elements, -462T(15) and -4T(12), are polymorphic in pancreatic carcinoma and colorectal cancer tissues, while functional analysis indicated that -4T(12) element may be important for transcriptional regulation. The haplotype 14/10 was the most common haplotype in pancreatic carcinoma tissue, present in 88% of cases. Haplotypes 10/12 and 9/12 were detected in 4% of colorectal cancer tissues each. In majority of pancreatic carcinoma cases (98%) either KRAS codon 12 mutation or SMAD4 gene promoter haplotype 14/10 was present.
These findings suggest that haplotypes 14/10, 10/12 and 9/12 in the SMAD4 gene promoter represent genetic markers that might be associated with specific malignancy and potentially exploited for diagnostics and monitoring of disease, alone or in combination with KRAS codon 12 mutation testing.
Authors Key words
karcinom pankreasa, SMAD4, KRAS
Authors Key words
pancreatic cancer, SMAD4, KRAS
Classification
616.37-006.6(043.3)
Subject
Karcinom pankreasa
Type
Tekst
Abstract (sr)
Karcinom pankreasa spada u najinvazivnije i najprogresivnije humane maligne bolesti. Genetske promene karakteristične za ovu bolest su aktivacija onkogena KRAS i inaktivacija tumor supresor gena p16, p53 i SMAD4. Novija istraživanja ukazuju na povezanost aktivacije onkogena KRAS i inaktivacije tumor supresor gena SMAD4 u pankreasnoj karcinogenezi. Struktura promotora gena SMAD4 nedovoljno je proučena i malo se zna o mehanizmima regulacije transkripcije ovog gena. Ova studija je imala za cilj da istraži genetske i epigenetske promene u 5’ regulatornom regionu gena SMAD4 kao potencijalne mehanizme njegove inaktivacije u karcinomu pankreasa, kao i njihovu udruženost sa prisustvom mutacije u kodonu 12 gena KRAS u malignom tkivu.
Strukturna analiza promotora gena SMAD4 je pokazala da su dva mononukleotidna ponovka, -462T(15) and -4T(12), polimorfna u karcinomu pankreasa i kolorektalnom kanceru, dok je funkcionalna analiza pokazala da broj timina u elementu -4T(12) može biti od značaja za regulaciju transkripcije. Haplotip 14/10 je bio najčešći haplotip u tkivu karcinoma pankreasa, prisutan u 88% slučajeva. Haplotipovi 10/12 i 9/12 su otkriveni u po 4% slučajeva u tkivu kolorektalnog kancera. U najvećem broju tkiva karcinoma pankreasa (98%) bila je prisutna ili mutacija u kodonu 12 gena KRAS ili haplotip 14/10 u promotoru gena SMAD4.
Rezultati ovog istraživanja ukazuju da haplotipovi 14/10, 10/12 i 9/12 u promotoru gena SMAD4 predstavljaju genetičke markere koji mogu biti povezani sa specifičnom malignom bolešću, a njihova analiza potencijalno iskorišćena za dijagnostikovanje i praćenje bolesti, pojedinačno ili u kombinaciji sa analizom mutacije u kodonu 12 gena KRAS.
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.