Title
Identifikacija molekularno-genetičkih markera patogeneze akutne mijeloidne leukemije
Creator
Marjanović, Irena M., 1985-
Copyright date
2017
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 12.03.2018.
Other responsibilities
mentor
Tošić, Nataša
mentor
Pavlović, Sonja, 1960-
član komisije
Savić Pavićević, Dušanka, 1972-
član komisije
Tošić, Nataša
član komisije
Pavlović, Sonja, 1960-
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
Academic Title
-
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Identification of molecular genetic markers of acute myeloid leukemia pathogenesis
Publisher
[I. M. Marjanović]
Format
152 lista
description
molekularna biologija - molekularna biologija eukariota / molecular biology
- molecular biology of eukaryotes
Abstract (sr)
Akutna mijeloidna leukemija (AML) predstavlja grupu hematoloških malignih oboljenja koju karakteriše heterogeni genetički i epigenetički profil. AML sa normalnim kariotipom (AML-NK) predstavlja najveću podgrupu u okviru AML, koju odlikuje intermedijarni rizik. Međutim, samo 40% obolelih od AML-NK preživljava duže od 5 godina, pa je neophodno otkriti molekularno-genetičke markere značajne za prognozu i praćenje toka bolesti, rano otkrivanje minimalne rezidualne bolesti (MRB) i izbor odgovarajuće terapije, kako bi bila omogućena bolja stratifikacija pacijenata sa AML-NK.
Prvi cilj ove studije je analiza mutacionog profila dečje (dAML) i adultne (aAML) koja će doprineti rasvetljenju patogeneze mijeloidnih leukemija. Drugi cilj predstavlja određivanje nivoa ekspresije WT1, EVI1, BAALC i MN1 gena, kao potencijalnih molekularno-genetičkih markera značajnih za AML-NK.
Analizirani su neselektovani DNK uzorci 20 dAML i 20 aAML pacijenata, primenom metode targetovanog sekvenciranja nove generacije (eng. „targeted next generation sequencing“ – NGS), TruSeq Amplicon - Cancer Panel (TSACP) esejem, koji omogućava detekciju somatskih mutacija u 48 gena uključenih u kancerogenezu. U drugom delu ove studije nivo ekspresije gena WT1 (104 pacijenta), EVI1 (104 pacijenta), BAALC (111 pacijenata) i MN1 (111 pacijenata) u mononuklearnim ćelijama koštane srži AML-NK pacijenata i zdravih pojedinaca analiziran je real-time PCR metodom.
Rezultati su pokazali da AML sadrži relativno mali broj genetičkih promena, u proseku samo 3 mutacije po pacijentu kod aAML i dAML grupe pacijenata. Zastupljenost najčešćih mutacija u pojedinačnim genima, koji su povezani sa patogenezom AML, razlikovala se kod dAML i aAML: IDH1 (0% kod dAML, 5% kod aAML), IDH2 (0% kod dAML, 10% kod aAML), NPM1 (10% kod dAML, 35% kod aAML). Takođe, prisustvo mutacija u 4 gena (JAK3, ABL1, GNAQ i EGFR) koji kodiraju tirozin kinaze ili proteine koji su udruženi sa tirozin kinazama detektovano je isključivo kod dAML pacijenata, dok je kod 5 gena (IDH1, APC, HNF1A, GNAS i SMARCB1) koji su uključeni u metilaciju i modifikaciju histona prisustvo mutacija utvrđeno isključivo kod
aAML pacijenata...
Abstract (en)
Acute myeloid leukemia (AML) is a group of haematological malignancies characterized by a heterogeneous genetic and epigenetic profile. AML with normal karyotype (AML-NK) represents the largest subgroup within the AML, characterized by an intermediate risk. However, only 40% of patients with AML-NK survive for more than 5 years, so it is necessary to detect molecular genetic markers significant for prognosis and disease monitoring, early detection of minimum residual disease (MRD), and the selection of appropriate therapy in order to enable better stratification of patients with AML-NK.
The first aim of this study is the analysis of the mutation profile of childhood (cAML) and adult (aAML) AML which will contribute to the clarification of the pathogenesis of myeloid leukemia. The second aim is to determine the level of expression of WT1, EVI1, BAALC and MN1 gene, as potential molecular genetic markers relevant to AML-NK.
Unselected DNA samples of 20 cAMLs and 20 aAML patients were analyzed using the targeted next generation sequencing (NGS) method, on the TruSeq Amplicon-Cancer Panel (TSACP), which enables the detection of somatic mutations in 48 genes involved in carcinogenesis. In the second part of this research, the level of expression of the genes WT1 (104 patients), EVI1 (104 patients), BAALC (111 patients) and MN1 (111 patients) was analyzed in mononuclear bone marrow cells of AML-NK patients and healthy individuals by the real-time PCR method.
The results showed that the AML contains a relatively small number of genetic changes, on average only 3 mutations per patient in the aAML and cAML group. The incidence of the most common mutations in individual genes, which are associated with AML pathogenesis, differed in cAML and aAML: IDH1 (0% in cAML, 5% in aAML), IDH2 (0% in cAML, 10% in aAML), NPM1 (10% in cAML, 35% in aAML). Also, the presence of mutations in 4 genes (JAK3, ABL1, GNAQ, and EGFR) that encode tyrosine kinases or proteins that are associated with tyrosine kinases were detected exclusively in cAML patients, while in 5 genes (IDH1, APC, HNF1A, GNAS and SMARCB1) involved in methylation and histone modification, the presence of mutations was
found exclusively in aAML patients...
Authors Key words
akutna mijeloidna leukemija sa normalnim kariotipom (AML-NK); Next Generation Sequencing (NGS); WT1 ekspresija; EVI1 ekspresija; BAALC ekspresija; MN1 ekspresija
Authors Key words
acute myleoid leukemia with normal karyotype (AML-NK); Next Generation Sequencing (NGS); WT1 expression; EVI1 expression; BAALC expression; MN1 expression
Classification
616.155.392:616-092(043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Akutna mijeloidna leukemija (AML) predstavlja grupu hematoloških malignih oboljenja koju karakteriše heterogeni genetički i epigenetički profil. AML sa normalnim kariotipom (AML-NK) predstavlja najveću podgrupu u okviru AML, koju odlikuje intermedijarni rizik. Međutim, samo 40% obolelih od AML-NK preživljava duže od 5 godina, pa je neophodno otkriti molekularno-genetičke markere značajne za prognozu i praćenje toka bolesti, rano otkrivanje minimalne rezidualne bolesti (MRB) i izbor odgovarajuće terapije, kako bi bila omogućena bolja stratifikacija pacijenata sa AML-NK.
Prvi cilj ove studije je analiza mutacionog profila dečje (dAML) i adultne (aAML) koja će doprineti rasvetljenju patogeneze mijeloidnih leukemija. Drugi cilj predstavlja određivanje nivoa ekspresije WT1, EVI1, BAALC i MN1 gena, kao potencijalnih molekularno-genetičkih markera značajnih za AML-NK.
Analizirani su neselektovani DNK uzorci 20 dAML i 20 aAML pacijenata, primenom metode targetovanog sekvenciranja nove generacije (eng. „targeted next generation sequencing“ – NGS), TruSeq Amplicon - Cancer Panel (TSACP) esejem, koji omogućava detekciju somatskih mutacija u 48 gena uključenih u kancerogenezu. U drugom delu ove studije nivo ekspresije gena WT1 (104 pacijenta), EVI1 (104 pacijenta), BAALC (111 pacijenata) i MN1 (111 pacijenata) u mononuklearnim ćelijama koštane srži AML-NK pacijenata i zdravih pojedinaca analiziran je real-time PCR metodom.
Rezultati su pokazali da AML sadrži relativno mali broj genetičkih promena, u proseku samo 3 mutacije po pacijentu kod aAML i dAML grupe pacijenata. Zastupljenost najčešćih mutacija u pojedinačnim genima, koji su povezani sa patogenezom AML, razlikovala se kod dAML i aAML: IDH1 (0% kod dAML, 5% kod aAML), IDH2 (0% kod dAML, 10% kod aAML), NPM1 (10% kod dAML, 35% kod aAML). Takođe, prisustvo mutacija u 4 gena (JAK3, ABL1, GNAQ i EGFR) koji kodiraju tirozin kinaze ili proteine koji su udruženi sa tirozin kinazama detektovano je isključivo kod dAML pacijenata, dok je kod 5 gena (IDH1, APC, HNF1A, GNAS i SMARCB1) koji su uključeni u metilaciju i modifikaciju histona prisustvo mutacija utvrđeno isključivo kod
aAML pacijenata...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.