Title
Diverzitet kompleksa vrste Fusarium graminearum patogena strnih žita i kukuruza u Srbiji
Creator
Obradović, Ana M., 1986-
Copyright date
2017
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 17.04.2018.
Other responsibilities
mentor
Delibašić, Goran, 1958-
mentor
Stanković, Slavica
član komisije
Bulajić, Aleksandra, 1964-
član komisije
Nikolić, Ana
član komisije
Ignjativić-Micić, Dragana
Academic Expertise
Biotehnološke nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Poljoprivredni fakultet
Alternative title
Diversity of the Fusarium graminearum species complex a pathogen of small grains and maize in Serbia
Publisher
[A. M. Obradović]
Format
172 lista
description
Biotehničke nauke - Fitopatologija / Biotechnical sciences - Phytopathology
Abstract (sr)
Za proučavanje diverziteta vrste F. graminearum odabran je 101 izolat iz
kolekcije Laboratorije za fitopatologiju Instituta za kukuruz "Zemun Polje" koji su
prethodno identifikovani konvencionalnim metodama na osnovu makroskopskih i
mikroskopskih svojstava. Izolati su prikupljeni u periodu od 1993. do 2015. godine, a
poreklom iz uzoraka pšenice (42), kukuruza (37) i ječma (22) iz 41 lokaliteta na
teritoriji Srbije. Sa ciljem da se dobije uvid o rasprostranjenosti, prisustvu i diverzitetu
vrsta Fusarium graminearum kompleksa (Fg) kao i o trihotecenskim hemotipovima u
Srbiji, obavljena su proučavanja morfoloških, patogenih, toksigenih i filogenetskih
svojstava odabranih izolata. Na osnovu svih proučenih svojstava utvrđeno je prisustvo
tri vrste u okviru Fg kompleksa: Fusarium graminearum sensu stricto, Fusarium
boothii i Fusarium vorosii. Po prvi put u Srbiji, detektovano je prisustvo F. boothii i F.
vorosii patogena strnih žita i kukuruza u našoj zemlji.
Na osnovu morfoloških, patogenih i toksigenih svojstava uočen je veliki
diverzitet ispitivanih izolata. Rezultati analize morfoloških svojstava izolata F.
graminearum ss, F. boothii i F. vorosii, ukazuju da ne postoje razlike među njima.
Izolati vrste F. boothii i F. vorosii ispoljili su generalno slabiju patogenost u poređenju
sa ostalim izolatima. Analiza potencijala produkcije mikotoksina deoksinivalenola i
zearalenona ELISA i HPLC metodom ukazala je na varijabilnost između ispitivanih
izolata. Određivanjem trihotecenskih hemotipova hemijskom analizom utvrđeno je da u
Srbiji postoje dva hemotipa - 15ADON (dominantan) i 3ADON.
Za razliku od hemijskih, molekularnim analizama na osnovu TRI3 i TRI12 gena,
utvrđeno je prisustvo samo 15ADON hemotipa. Dobijeni rezultati o biodiverzitetu
hemotipova su prvi nalaz u agroekološkim uslovima Srbije. Analiza nukleotidnih
sekvenci tri genomska regiona (TEF−1α, β−tubulin i histon H3), pokazala je da postoje
različiti potencijali za razdvajanje vrsta u okviru Fg kompleksa. Rezultati ove disertacije
ukazali su na postojanje dve vrste u okviru Fg kompleksa (F. boothii i F. vorosii), koje
do sada nisu identifikovane na teritoriji Srbije. Sekvenciranje ovih genomskih regiona
odabranih izolata i njihovo poređenje sa referentnim izolatima kao i poređenje sa
izolatima Fg kompleksa u svetu doprinelo je boljem poznavanju biodiverziteta ovih
vrsta u Srbiji.
Abstract (en)
One hundred and one isolates of the F. graminearum species have been isolated
from the collection of the Laboratory of Phytopathology of the Maize Research
Institute, Zemun Polje to study the species diversity. These isolates had been previously
identified using conventional methods based on macroscopic and microscopic
properties. Isolates, originating from samples of wheat (42), maize (37) and barley (22),
were collected from 41 locations in Serbia in the period from 1993 to 2015. In order to
gain insight into the distribution, presence and diversity of the Fusarium graminearum
species complex (Fg), as well as into thrichotecene chemotypes in Serbia, studies of the
morphological, pathogenic, toxigenic and phylogenetic properties of the selected
isolates were carried out. According to all observed properties, the presence of the three
following species was determined within the Fg complex: Fusarium graminearum
sensu stricto, Fusarium boothii and Fusarium vorosii. F. boothii and F. vorosii,
pathogens of small grains and maize in our country, were detected for the first time in
Serbia.
Based on morphological, pathogenic and toxigenic properties, a great diversity
of analysed isolates was observed. Results of analyses of morphological properties of
the isolates of F. graminearum ss, F. boothii and F. vorosii, pointed out that there had
been no differences among them. Isolates of F. boothii and F. vorosii species exhibited
generally less pathogenicity than remaining isolates. The analysis of the potential for the
production of mycotoxins deoxynivalenol and zearalenone by the ELISA and the HPLC
method pointed out to the variability among analysed isolates. The determination of
trichothecene chemotypes done by chemical analyses confirmed the presence of two
chemotypes in Serbia- 15ADON (dominant) and 3ADON. In contrast to chemical
analyses, the molecular analyses, based on the TRI3 and TRI12 genes, established the
presence of only 15ADON chemotype. The obtained results on the biodiversity of
chemotypes are the first finding under agroecological conditions of Serbia. The analysis
of nucleotide sequences of the three genomic regions (TEF−1α, β−tubulin and histone
H3), showed the existence of different potentials for separation of species within the Fg
complex. The results presented in this PhD thesis point out to the existence of two
species (F. boothii and F. vorosii) within the Fg complex, which have not yet been
identified in the territory of Serbia. Sequencing these portions of the genome of the
selected isolates and their comparison with the reference isolates, as well as, the
comparison with the Fg complex isolates in the world contributed to a better knowledge
of the biodiversity of these species in Serbia.
Authors Key words
Fg kompleks, F. boothii, F. vorosii, F. graminearum, diverzitet, strna
žita, kukuruz
Authors Key words
Fg complex, F. boothii, F. vorosii, F. graminearum, diversity, small
grains, maize
Classification
632.4:633.15(497.11)(043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Za proučavanje diverziteta vrste F. graminearum odabran je 101 izolat iz
kolekcije Laboratorije za fitopatologiju Instituta za kukuruz "Zemun Polje" koji su
prethodno identifikovani konvencionalnim metodama na osnovu makroskopskih i
mikroskopskih svojstava. Izolati su prikupljeni u periodu od 1993. do 2015. godine, a
poreklom iz uzoraka pšenice (42), kukuruza (37) i ječma (22) iz 41 lokaliteta na
teritoriji Srbije. Sa ciljem da se dobije uvid o rasprostranjenosti, prisustvu i diverzitetu
vrsta Fusarium graminearum kompleksa (Fg) kao i o trihotecenskim hemotipovima u
Srbiji, obavljena su proučavanja morfoloških, patogenih, toksigenih i filogenetskih
svojstava odabranih izolata. Na osnovu svih proučenih svojstava utvrđeno je prisustvo
tri vrste u okviru Fg kompleksa: Fusarium graminearum sensu stricto, Fusarium
boothii i Fusarium vorosii. Po prvi put u Srbiji, detektovano je prisustvo F. boothii i F.
vorosii patogena strnih žita i kukuruza u našoj zemlji.
Na osnovu morfoloških, patogenih i toksigenih svojstava uočen je veliki
diverzitet ispitivanih izolata. Rezultati analize morfoloških svojstava izolata F.
graminearum ss, F. boothii i F. vorosii, ukazuju da ne postoje razlike među njima.
Izolati vrste F. boothii i F. vorosii ispoljili su generalno slabiju patogenost u poređenju
sa ostalim izolatima. Analiza potencijala produkcije mikotoksina deoksinivalenola i
zearalenona ELISA i HPLC metodom ukazala je na varijabilnost između ispitivanih
izolata. Određivanjem trihotecenskih hemotipova hemijskom analizom utvrđeno je da u
Srbiji postoje dva hemotipa - 15ADON (dominantan) i 3ADON.
Za razliku od hemijskih, molekularnim analizama na osnovu TRI3 i TRI12 gena,
utvrđeno je prisustvo samo 15ADON hemotipa. Dobijeni rezultati o biodiverzitetu
hemotipova su prvi nalaz u agroekološkim uslovima Srbije. Analiza nukleotidnih
sekvenci tri genomska regiona (TEF−1α, β−tubulin i histon H3), pokazala je da postoje
različiti potencijali za razdvajanje vrsta u okviru Fg kompleksa. Rezultati ove disertacije
ukazali su na postojanje dve vrste u okviru Fg kompleksa (F. boothii i F. vorosii), koje
do sada nisu identifikovane na teritoriji Srbije. Sekvenciranje ovih genomskih regiona
odabranih izolata i njihovo poređenje sa referentnim izolatima kao i poređenje sa
izolatima Fg kompleksa u svetu doprinelo je boljem poznavanju biodiverziteta ovih
vrsta u Srbiji.
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.