Title
Identifikacija i karakterizacija fitopatogenih gljiva prouzrokovača bolesti stabla kupine u Srbiji
Creator
Stevanović, Miloš, 1984- 9609575
Copyright date
2019
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 30.05.2019.
Other responsibilities
mentor
Bulajić, Aleksandra, 1964- 12652903
mentor
Živković, Svetlana, 1967- 12112487
član komisije
Aleksić, Goran, 1963- 13674599
član komisije
Delibašić, Goran, 1958- 12497255
član komisije
Ristić, Danijela, 1977- 18104935
član komisije
Tanović, Brankica, 1970- 16391015
član komisije
Nikolić, Mihailo, 1954- 12425319
Academic Expertise
Biotehnološke nauke
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Poljoprivredni fakultet
Alternative title
Identification and characterisation of phytopathogenic fungi causing blackberry cane diseases in Serbia
Publisher
[M. Lj. Stevanović]
Format
181 list
description
Biotehničke nauke - Fitopatologija / Biotechnical Science - Phytopathology
Abstract (sr)
Tokom ispitivanja sprovedenog u periodu od 2013. do 2016. godine, pregledom
pet komercijalno značajnijih sorti kupine na 24 lokaliteta u 13 okruga u Srbiji,
ustanovljena je široka rasprostranjenost bolesti stabla kupine (incidenca 5 - 80%,
prosečno 37,7%), a nekroza i pucanje kore bili su najčešći simptomi. U pojedinim
lokalitetima zabeleženo je sušenje 40% biljaka uz direktno smanjenje prinosa od oko
50%. Rasvetljavanje etiologije bolesti stabla kupine u Srbiji obavljeno je kroz morfološku
i molekularnu identifikaciju i karakterizaciju 468 izolata dobijenih iz 427 uzoraka. Nakon
ispunjenja Kohovih postulata, na osnovu makroskopskih i mikroskopskih osobina
dobijeni izolati izdvojeni su u 10 morfoloških grupa što je potvrđeno sekvenciranjem ITS
regiona rDNA. Identifikovano je 10 vrsta gljiva prouzrokovača bolesti stabla kupine u
Srbiji: Paraconiothyrium fuckelii, Gnomoniopsis idaeicola, Septoria spp.,
Botryosphaeria dothidea, Diplodia seriata, Botrytis cinerea, Colletotrichum kahawae,
Diaporthe eres, Diaporthe betulae i Neofusicoccum parvum. Dodatna karakterizacija na
osnovu filogenetskih analiza urađena je za vrste G. idaeicola, B. dothidea, D. seriata, C.
kahawae, D. eres, D. betulae i N. parvum čime je određena njihova srodnost i međuodnos
sa ostalim vrstama rodova Gnomoniopsis, Botryosphaeria, Diplodia, Colletotrichum,
Diaporthe i Neofusicoccum. Izolate Septoria spp. moguće je bilo identifikovani do nivoa
roda na osnovu morfoloških, patogenih i molekularnih odlika i biće predmet daljih
istraživanja uz sekvenciranje dodatnih molekularnih markera.
Tokom ovih istraživanja vrsta G. idaeicola prvi put je opisana na kupini u Srbiji, a
kako se pokazalo da je rasprostranjena u skoro polovini ispitivanih zasada, to predstavlja
i prvu masovnu pojavu na kupini u svetu kao i prvi uvid u moguću epidemiologiju nekroze
stabla i sušenja kupine izazvane sa G. idaeicola. Izolati G. idaeicola iz Srbije ispoljili su
morfološku, molekularnu i biološku varijabilnost što je ustanovljeno po prvi put u svetu.
Utvrđena je različita brzina porasta i izgled kolonija, različito vreme i način sporulacije,
kao i različita virulentnost. Filogenetske analize kombinovanih sekvenci za ITS region
rDNA, β-tubulin, tef-1α i FG1093 otkriva postojanje dve odvojene grupe u okviru
klastera G. idaeicola...
Abstract (en)
A Survey was conducted from 2013 to 2016 which included a total of 24
orchards planted with five of the most commonly grown blackberry cultivars in 13
administrative districts in Serbia. A wide distribution of blackberry cane diseases
(incidence of 5 - 80%, with an average of 37,7%) was observed with the most frequent
symptoms of bark necrosis and canker. In some of the localities, the wilting of up to 40%
of plants was recorded with yield reduction of about 50%. The etiology of blackberry
cane diseases was investigated through morphological and molecular identification and
characterization of 468 isolates obtained from 427 samples. After fulfilling the Koch’s
postulates, the isolates were grouped into 10 morphological groups based on macroscopic
and microscopic features which were confirmed by the sequencing of the ITS region
rDNA. Ten species of fungi causing blackberry cane diseases were identified including
Paraconiothyrium fuckelii, Gnomoniopsis idaeicola, Septoria spp., Botryosphaeria
dothidea, Diplodia seriata, Botrytis cinerea, Colletotrichum kahawae, Diaporthe eres,
Diaporthe betulae and Neofusicoccum parvum. Additional characterization based on
phylogenetic analysis was performed for G. idaeicola, B. dothidea, D. seriata, C.
kahawae, D. eres, D. betulae and N. parvum and revealed their relationship to the
additional species within the genera of Gnomoniopsis, Botryosphaeria, Diplodia,
Colletotrichum, Diaporthe and Neofusicoccum. Isolates of Septoria spp. could be
identified to the genus level based on morphological, pathogenic and molecular features
and will be subjected to further research through sequencing of additional molecular
markers.
During this research G. idaeicola was detected on blackberries in Serbia for the first
time. As it was found that G. idaeicola was distributed in almost half of the orchards, this
is the first record of a massive outbreak of G. idaeicola on blackberries in the world as
well as the first insight into the possible epidemiology of cane necrosis and wilting of
blackberries caused by this fungus. The isolates G. idaeicola from Serbia exhibited
morphological, molecular and biological variability which was recorded for the first time
in the world. More specifically, different growth patterns and rates, sporulation patterns
and virulence were documented...
Authors Key words
kupina, bolesti stabla, Paraconiothyrium fuckelii, Gnomoniopsis idaeicola,
Septoria spp., Botryosphaeria dothidea, Diplodia seriata, Botrytis cinerea,
Colletotrichum kahawae, Diaporthe eres, Diaporthe betulae, Neofusicoccum parvum,
identifikacija, morfologija, molekularna identifikacija, filogenetske analize, virulentnost
Authors Key words
blackberry, cane diseases, Paraconiothyrium fuckelii, Gnomoniopsis
idaeicola, Septoria spp., Botryosphaeria dothidea, Diplodia seriata, Botrytis cinerea,
Colletotrichum kahawae, Diaporthe eres, Diaporthe betulae, Neofusicoccum parvum,
identification, morphology, molecular identification, phylogenetic analysis, virulence
Classification
634.713:632.48(497.11)(043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Tokom ispitivanja sprovedenog u periodu od 2013. do 2016. godine, pregledom
pet komercijalno značajnijih sorti kupine na 24 lokaliteta u 13 okruga u Srbiji,
ustanovljena je široka rasprostranjenost bolesti stabla kupine (incidenca 5 - 80%,
prosečno 37,7%), a nekroza i pucanje kore bili su najčešći simptomi. U pojedinim
lokalitetima zabeleženo je sušenje 40% biljaka uz direktno smanjenje prinosa od oko
50%. Rasvetljavanje etiologije bolesti stabla kupine u Srbiji obavljeno je kroz morfološku
i molekularnu identifikaciju i karakterizaciju 468 izolata dobijenih iz 427 uzoraka. Nakon
ispunjenja Kohovih postulata, na osnovu makroskopskih i mikroskopskih osobina
dobijeni izolati izdvojeni su u 10 morfoloških grupa što je potvrđeno sekvenciranjem ITS
regiona rDNA. Identifikovano je 10 vrsta gljiva prouzrokovača bolesti stabla kupine u
Srbiji: Paraconiothyrium fuckelii, Gnomoniopsis idaeicola, Septoria spp.,
Botryosphaeria dothidea, Diplodia seriata, Botrytis cinerea, Colletotrichum kahawae,
Diaporthe eres, Diaporthe betulae i Neofusicoccum parvum. Dodatna karakterizacija na
osnovu filogenetskih analiza urađena je za vrste G. idaeicola, B. dothidea, D. seriata, C.
kahawae, D. eres, D. betulae i N. parvum čime je određena njihova srodnost i međuodnos
sa ostalim vrstama rodova Gnomoniopsis, Botryosphaeria, Diplodia, Colletotrichum,
Diaporthe i Neofusicoccum. Izolate Septoria spp. moguće je bilo identifikovani do nivoa
roda na osnovu morfoloških, patogenih i molekularnih odlika i biće predmet daljih
istraživanja uz sekvenciranje dodatnih molekularnih markera.
Tokom ovih istraživanja vrsta G. idaeicola prvi put je opisana na kupini u Srbiji, a
kako se pokazalo da je rasprostranjena u skoro polovini ispitivanih zasada, to predstavlja
i prvu masovnu pojavu na kupini u svetu kao i prvi uvid u moguću epidemiologiju nekroze
stabla i sušenja kupine izazvane sa G. idaeicola. Izolati G. idaeicola iz Srbije ispoljili su
morfološku, molekularnu i biološku varijabilnost što je ustanovljeno po prvi put u svetu.
Utvrđena je različita brzina porasta i izgled kolonija, različito vreme i način sporulacije,
kao i različita virulentnost. Filogenetske analize kombinovanih sekvenci za ITS region
rDNA, β-tubulin, tef-1α i FG1093 otkriva postojanje dve odvojene grupe u okviru
klastera G. idaeicola...
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.