Title
Identifikovanje i karakterizacija ćelijskih faktora uključenih u procres obnavljanja populacije ćelija Ustilago maydis nakon oksidativnog stresa
Creator
Malešević, Jelena, 1990-
CONOR:
85643273
Copyright date
2021
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 16.05.2022.
Other responsibilities
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
Academic Title
-
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Identification and characterization of cells factors involved in regeneration of the Ustilago maydis population after oxidative stress
Publisher
[J. J. Malešević]
Format
82 str.
description
Biologija - Molekularna biologija eukariota / Biology - Molecular Biology of eukaryotes
Abstract (sr)
Ustilago maydis je patogena gljiva kukuruza, otporna na ekstremne doze UV i jonizujućeg zračenja. U prirodi U. maydis prolazi kroz dva životna stadijuma, tokom kojih je izložen različitim vrstama stresa. Studije su pokazale da DNK reparacija ima veliki doprinos u oporavku populacije nakon snažnog stresa. Međutim, razumevanje molekularne osnove ekološkog uspeha U. maydis je ostalo nepotpuno. Cilj ovog istraživanja je bilo pružanje jasnijeg uvida u mehanizme koji omogućavaju opstanak populacije ustilaga u nepovoljnim uslovima. Kao metodološki pristup za istraživanje oporavka od snažnog oksidativnog stresa, primenjen je LH test (Liquid Holding)-praćenje vijabilnosti tretiranih ćelija tokom inkubacije u vodi. Rezultati su pokazali da U. maydis ima visok stepen opravka populacije i da se ova obnova ostvaruje multiplikacijom preživelih ćelija zahvaljujući njihovoj sposobnosti da preuzmu i recikliraju produkte degradacije umrlih ćelija. Identifikovano je i okarakterisano 10 ćelijskih faktora (Adr1, Did4, Kel1, Tbp1, Snf8, Slm1, Chk1, Gmt, Snf5, Hsf1) uključenih u proces, putem izolovanja mutanata koji su izgubili sposobnost obnove vijabilnosti populacije (RUS). Poznate su uloge identifikovanih ćelijskih faktora u različitim ćelijskim procesima, a ovo je istraživanje pokazalo da su neki od RUS-faktora uključeni u održavanje integriteta genoma. Takođe je pokazano i da je ustilago metabolički aktivan u vodi i da nakon pada brojnosti populacije usled autogenerisane hipoksije, koristeći RUS, uspeva da obnovi populaciju i u normoksičnim i u hipoksičnim uslovima. Sumirano, RUS bi mogao da predstavlja adaptaciju koja povećava fitnes U. maydis u nepovoljnim uslovima, putem repopulacije nakon delovanja različitih stresogenih faktora.
Abstract (en)
Ustilago maydis is a pathogenic corn fungus, resistant to extreme doses of UV and ionizing radiation. In nature, U. maydis passes through two life stages, during which it is exposed to different types of stresses. Studies have shown that DNA reparation makes a major contribution to the recovery of the population after severe stress. However, understanding the molecular basis of environmental success of U. maydis remained incomplete. The aim of this research was to provide a clear insight into the mechanisms that enable survival of U. maydis population in unfavorable conditions. As methodoligical approach for investigation of recovery from strong oxidative stress, LH assay (Liquid Holding)- monitoring of viability of treated cells during incubation in water, was applied. The results showed that U. maydis had a high degree of population recovery, and that this renewal was accomplished by multiplication of the surviving cells at the expense of the released biomolecules from dead cells. Ten cellular factors (Adr1, Did4, Kel1, Tbp1, Snf8, Slm1, Chk1, Gmt, Snf5, Hsf1) involved in the process were identified and characterized, by isolating mutants that lost the ability to restore population viability (RUS). The roles in various cellular processes of the identified factors heave been already known, and this research showed that some of the RUS factors were involved in maintainance of genome integrity. It was also shown that U. maydis was metabolically active in water and that after population decline due to autogenerated hypoxia, it managed to reconstitute the population in both normoxic and hypoxic conditions, employing RUS. In summary, RUS could be an adaptation that increases fitness of U. maydis in adverse conditions, by repopulation after expsoure to various stressors.
Authors Key words
repopulacija nakon gladovanja, oksidativni stres, vijabilnost, DNK reparacija, Ustilago maydis
Authors Key words
repopulation under starvation, oxidative stress, viability, DNA repair, Ustilago maydis
Classification
577.2:576.3(043.3)
Type
Tekst
Abstract (sr)
Ustilago maydis je patogena gljiva kukuruza, otporna na ekstremne doze UV i jonizujućeg zračenja. U prirodi U. maydis prolazi kroz dva životna stadijuma, tokom kojih je izložen različitim vrstama stresa. Studije su pokazale da DNK reparacija ima veliki doprinos u oporavku populacije nakon snažnog stresa. Međutim, razumevanje molekularne osnove ekološkog uspeha U. maydis je ostalo nepotpuno. Cilj ovog istraživanja je bilo pružanje jasnijeg uvida u mehanizme koji omogućavaju opstanak populacije ustilaga u nepovoljnim uslovima. Kao metodološki pristup za istraživanje oporavka od snažnog oksidativnog stresa, primenjen je LH test (Liquid Holding)-praćenje vijabilnosti tretiranih ćelija tokom inkubacije u vodi. Rezultati su pokazali da U. maydis ima visok stepen opravka populacije i da se ova obnova ostvaruje multiplikacijom preživelih ćelija zahvaljujući njihovoj sposobnosti da preuzmu i recikliraju produkte degradacije umrlih ćelija. Identifikovano je i okarakterisano 10 ćelijskih faktora (Adr1, Did4, Kel1, Tbp1, Snf8, Slm1, Chk1, Gmt, Snf5, Hsf1) uključenih u proces, putem izolovanja mutanata koji su izgubili sposobnost obnove vijabilnosti populacije (RUS). Poznate su uloge identifikovanih ćelijskih faktora u različitim ćelijskim procesima, a ovo je istraživanje pokazalo da su neki od RUS-faktora uključeni u održavanje integriteta genoma. Takođe je pokazano i da je ustilago metabolički aktivan u vodi i da nakon pada brojnosti populacije usled autogenerisane hipoksije, koristeći RUS, uspeva da obnovi populaciju i u normoksičnim i u hipoksičnim uslovima. Sumirano, RUS bi mogao da predstavlja adaptaciju koja povećava fitnes U. maydis u nepovoljnim uslovima, putem repopulacije nakon delovanja različitih stresogenih faktora.
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.