Title
Superoksid-dismutaze krompira (Solanum tuberosum L.): karakterizacija izoformi i ekspresija u uslovima visokih temperatura
Creator
Rudić, Jelena, 1983-
CONOR:
103279113
Copyright date
2023
Object Links
Select license
Autorstvo-Nekomercijalno-Bez prerade 3.0 Srbija (CC BY-NC-ND 3.0)
License description
Dozvoljavate samo preuzimanje i distribuciju dela, ako/dok se pravilno naznačava ime autora, bez ikakvih promena dela i bez prava komercijalnog korišćenja dela. Ova licenca je najstroža CC licenca. Osnovni opis Licence: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/deed.sr_LATN. Sadržaj ugovora u celini: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/rs/legalcode.sr-Latn
Language
Serbian
Cobiss-ID
Theses Type
Doktorska disertacija
description
Datum odbrane: 04.07.2023.
Other responsibilities
Academic Expertise
Prirodno-matematičke nauke
Academic Title
-
University
Univerzitet u Beogradu
Faculty
Biološki fakultet
Alternative title
Superoxide dismutases in potato (Solanum tuberosum L.): characterisation of isoforms and expression under high temperature
Publisher
[J. Rudić]
Format
118 стр.
description
Biologija - Fiziologija i molekularna biologija biljaka / Biology
- Plant Physiology and Molecular Biology
Abstract ()
Krompir (Solanum tuberosum L.) je među najznačajnijim poljoprivrednim usevima i veoma
je osetljiv na visoke temperature. Kao posledica toplotnog stresa dolazi do disbalansa u produkciji i
eliminaciji reaktivnih vrsta kiseonika (ROS) u biljnim ćelijama, odnosno pojave sekundarnog,
oksidativnog stresa. Superoksid-dismutaze (SOD) su važni antioksidativni enzimi uključeni u
odbranu biljnih ćelija od ROS, a koji do sada nisu detaljno izučeni kod krompira. Rezultati ovog rada
su pokazali da SOD genska familija krompira obuhvata osam gena (StCuZnSOD1-3, StMnSOD i
StFeSOD1-4), čiji su promotorski regioni i egzon-intron struktura transkripata ispitani in silico. In
silico analiza je obuhvatila i fizičko-hemijsku karakterizaciju StSOD proteina, identifikaciju SOD
domena, procenu prisustva N-terminalnog signala u peptidima, predikciju subćelijske lokalizacije i
tercijarne strukture StSOD, a utvrđeni su i filogenetski odnosi između StSOD i SOD drugih biljnih
vrsta. Ekspresija StSOD ispitivana je kod komercijalnih sorti krompira gajenih in vitro tokom
različitih temperaturnih tretmana. Pokazano je da su svih osam StSOD gena funkcionalni, kao i da su
šest gena visoko eksprimirani. Temperatura od 29 °C je najviše indukovala StSOD ekspresiju.
Takođe, kod ex vitro gajenih biljaka ustanovljena je povećana ekspresija StSOD u uslovima toplotnog
stresa (30/20°C, dan/noć), i to uglavnom nakon 7. dana tretmana. Zapaženo je da toplotni stres
indukuje ekspresiju gena za hloroplastne StSOD (StCuZnSOD2, StFeSOD2 i StFeSOD3) u listovima,
citosolne (StCuZnSOD1) i mitohondrijalne (StMnSOD) StSOD u stolonima, dok na ekspresiju StSOD
u drugim organima nije imao značajnijeg uticaja. Dati rezultati ukazuju da StSOD imaju važnu ulogu
u antioksidativnoj zaštiti ćelija listova i stolona krompira u uslovima visokih temperatura.
Abstract (sr)
Potato (Solanum tuberosum L.) is one of the most important vegetable crops and is very
sensitive to high temperatures. Heat stress causes an imbalance in the production and elimination of
reactive oxygen species (ROS) in plant cells, leading to secondary oxidative stress. Superoxide
dismutases (SODs) are important antioxidant enzymes involved in the defense of plant cells against
ROS, which have not been studied in detail in potato so far. The results of this work revealed that the
potato SOD gene family includes eight genes (StCuZnSOD1-3, StMnSOD and StFeSOD1-4), whose
promoter regions and transcript exon-intron structure were examined in silico. In silico analysis also
included physicochemical characterization of the StSOD proteins, identification of the SOD domains,
assessment of the N-terminal signal in the peptides, prediction of the subcellular localization and
tertiary structure of StSODs, and revealed the phylogenetic relationships between StSODs and SODs
of other plant species. The expression of StSOD was investigated in commercial potato varieties
grown in vitro during different temperature treatments. All eight StSOD genes were functional, and
six genes were highly expressed. A temperature of 29 °C induced StSOD expression the most. Also,
in ex vitro grown plants, an increased expression of StSOD was found under heat stress (30/20°C,
day/night), mainly after the 7th day of treatment. It was noted that heat stress predominantly induces
the expression of genes encoding chloroplast StSODs (StCuZnSOD2, StFeSOD2 and StFeSOD3) in
leaves, genes encoding cytosolic (StCuZnSOD1) and mitochondrial (StMnSOD) StSODs in stolons,
while it had no significant effect on the expression of StSODs in other organs. The obtained results
indicate that StSOD plays an important role in the antioxidant protection of potato leaf and stolon
cells under high temperature.
Authors Key words
Solanum tuberosum L., superoksid-dismutaze, toplotni stres, oksidativni
stres, antioksidativni enzimi
Authors Key words
Solanum tuberosum L., superoxide dismutases, heat stress, oxidative stress,
antioxydative enzymes
Classification
581.1:577.2(043.3)
Type
Tekst
Abstract ()
Krompir (Solanum tuberosum L.) je među najznačajnijim poljoprivrednim usevima i veoma
je osetljiv na visoke temperature. Kao posledica toplotnog stresa dolazi do disbalansa u produkciji i
eliminaciji reaktivnih vrsta kiseonika (ROS) u biljnim ćelijama, odnosno pojave sekundarnog,
oksidativnog stresa. Superoksid-dismutaze (SOD) su važni antioksidativni enzimi uključeni u
odbranu biljnih ćelija od ROS, a koji do sada nisu detaljno izučeni kod krompira. Rezultati ovog rada
su pokazali da SOD genska familija krompira obuhvata osam gena (StCuZnSOD1-3, StMnSOD i
StFeSOD1-4), čiji su promotorski regioni i egzon-intron struktura transkripata ispitani in silico. In
silico analiza je obuhvatila i fizičko-hemijsku karakterizaciju StSOD proteina, identifikaciju SOD
domena, procenu prisustva N-terminalnog signala u peptidima, predikciju subćelijske lokalizacije i
tercijarne strukture StSOD, a utvrđeni su i filogenetski odnosi između StSOD i SOD drugih biljnih
vrsta. Ekspresija StSOD ispitivana je kod komercijalnih sorti krompira gajenih in vitro tokom
različitih temperaturnih tretmana. Pokazano je da su svih osam StSOD gena funkcionalni, kao i da su
šest gena visoko eksprimirani. Temperatura od 29 °C je najviše indukovala StSOD ekspresiju.
Takođe, kod ex vitro gajenih biljaka ustanovljena je povećana ekspresija StSOD u uslovima toplotnog
stresa (30/20°C, dan/noć), i to uglavnom nakon 7. dana tretmana. Zapaženo je da toplotni stres
indukuje ekspresiju gena za hloroplastne StSOD (StCuZnSOD2, StFeSOD2 i StFeSOD3) u listovima,
citosolne (StCuZnSOD1) i mitohondrijalne (StMnSOD) StSOD u stolonima, dok na ekspresiju StSOD
u drugim organima nije imao značajnijeg uticaja. Dati rezultati ukazuju da StSOD imaju važnu ulogu
u antioksidativnoj zaštiti ćelija listova i stolona krompira u uslovima visokih temperatura.
“Data exchange” service offers individual users metadata transfer in several different formats. Citation formats are offered for transfers in texts as for the transfer into internet pages. Citation formats include permanent links that guarantee access to cited sources. For use are commonly structured metadata schemes : Dublin Core xml and ETUB-MS xml, local adaptation of international ETD-MS scheme intended for use in academic documents.